天然人参中的皂苷种类繁多，主要分为三类：人参二醇型（如Rb1、Rb2、Rc、Rd）、人参三醇型（如Re、Rg1、Rg2）和齐墩果酸型（如Ro）。不同品种的人参所包含的皂苷种类和含量是有差异的，主要采用高效液相色谱（HPLC）或液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）测定它们的含量。HPLC通过C18色谱柱吸附，用乙腈和0.1%磷酸水溶液梯度洗脱。LC-MS/MS通过高分辨率的C18色谱柱吸附，乙腈和0.1%甲酸水为流动相，从高比例水相开始梯度洗脱，用对应人参皂苷种类的离子对进行定性定量，用标准曲线计算含量。如果要定性的话，需要有比较完善的数据库。
人参皂苷的极性差异还是比较大的，极性大的易溶于水，极性小的微溶于水。根据调节流动相的比例改变流动相的极性，来接近于单个皂苷的极性，根据相似相容的原理，从色谱柱上有序洗脱下来。人参皂苷的极性是跟糖基的类型、数量、连接位置有关的，糖基越多，极性就越强。人参皂苷的糖基（鼠李糖、葡萄糖等）通过糖苷键链接到苷元的特定位置上，比如C-3，C-6，C-20。苷元是由30个碳原子组成的四环三萜，是皂苷骨架的核心。
判断分子是不是极性比较重要，要选择合适的色谱柱来吸附它，需要调节流动相中的比例来改变极性，进行有效洗脱。中心原子化合价法，就是看一个分子的中心原子，它的化合价绝对值是否和外层的电子数相同，就是一个人双手双脚都用上了，没有空余的地方，就是非极性的了。但凡有一个手或脚是空着，就变成了极性了。孤对电子法，就是看中心原子有没有孤对电子，没有的话就是非极性的，如果有的话就是极性分子。其实也很简单，就像其他人都有结合对象了，它一个人还空着，就是极性的了。比如H2O，氧原子上有2对孤对电子，它们位于氧原子的sp3杂化轨道上，不参与成键。这些孤对电子对成键的电子有排斥作用“你们都滚一边儿去”，进一步压缩了O和H共价键的键角到104.5℃，成V形弯曲，并增强了分子的极性。
人参皂苷的糖基上含有多个羟基（-OH），羟基是亲水性的基团，能和水分子形成氢键，从而增强了分子整体的极性和亲水性。皂苷也并不是纯极性的，它还含有非极性的基团，如皂苷元部分，表现为疏水性和非极性的特点。因此，可以用C18的色谱柱来吸附，并用乙腈和水来洗脱。如果极性远大于非极性，更容易被洗脱出来，可在流动相的水相中加入0.1%甲酸来增强保留，抑制离子化，减少拖尾，提升分离效率。要测具体多少种类的皂苷，就需要改变洗脱梯度、柱温、流速、进样量等来进行调节。