番茄红素是一种从番茄、南瓜、西瓜等红色蔬菜中提取出来的植物天然色素（类胡萝卜素），它的化学结构中含有11个共轭双键和2个非共轭双键，没有芳香环。它有共轭双键，就说明有紫外吸收能力，如果用液相色谱测定，可以用紫外检测器设定对应的波长。极性分子具有永久的偶极矩，非极性分子的偶极矩为零。番茄红素的碳氢结构是对称的，没有出现电负性差异导致的电荷偏移，没有孤电子对或不对称性，是非极性化合物，可以用C18色谱柱来吸附。
番茄红素易溶于二硫化碳、乙醚、氯仿，微溶于甲醇、乙醇、乙腈，不溶于水。番茄红素对光、热、氧及金属离子敏感，易降解。因此，在样品提取的过程中，可用乙醇溶液和0.1%BHT（抗氧化剂）来提取，低温避光操作。在提取的过程中，温度不要超过40℃，否则容易被氧化或异构化，通常是在25℃进行混匀或振荡3-4h。如果乙醇溶解度不够，可用乙醚或石油醚等非极性溶剂提取，之后通过氮吹浓缩，甲醇和0.1%BHT复溶，定容过滤。
用常规的C18色谱柱是没问题的，但流动相的选择是比较重要的。番茄红素不溶于水，那就要用甲醇和乙腈来进行洗脱。通过改变其中一个有机相的比例，来改变流动相的极性，从而达到将番茄红素从色谱柱固定相吸附位点上洗脱下来的目的。乙腈洗脱能力更强，更适合于疏水性化合物，甲醇对极性化合物的洗脱更适合。因此，洗脱番茄红素，乙腈是主力，甲醇是辅助。如果样品中仅仅是测番茄红素，可通过优化流动相的比例，等度洗脱（如乙腈：甲醇=65:35）。
等度洗脱就是固定流动相的比例，不随时间的变化而变化。番茄红素在有机相中是分配比例的，当在某个临界点的时候，能够达到有效洗脱。可以把色谱图中一个个的峰，当做是一个个的物质。在某个时间段内，虽然有机相比例是一样的，有的峰先出来，有的峰后出来，这就取决于物质和色谱柱固定相吸附能力。番茄红素的紫外吸收波长为445nm，可设置波长并记录信号峰，结束后可以对峰面积进行积分处理。标准品可以用二氯甲烷等有机溶剂来溶解，梯度稀释，得到对应的色谱峰，对各个峰面积进行积分，拟合出标准曲线，得到回归方程，相关系数R2要大于0.999并接近于1。还需要验证一下定量限，确保检测的结果在定量限范围内，保证结果的有效性。