锰是植物必需的微量营养元素，土壤中的锰一般是化学结合形式，以二价，三价，四价存在。各种形态的锰溶解度是有差异的，它在土壤固相和液相之间的分布与pH，Eh，配位体等有密切关系。土壤中锰的形态常分成水溶态、交换态、易还原态、有机结合态和矿物态。土壤中的锰是多种酶的激活剂，参与氮素转化，蛋白质的合成等。在叶绿体中也有锰的参与，才能更好的捕捉光能并进行转化。在植物的抗氧化过程中，锰也起着至关重要的作用，从而保护了细胞免受损害。
土壤锰含量一般在20-500mg/kg之间，锰含量不足会影响到植物的生长代谢，如果锰含量过高也会造成重金属污染。因此，科研检测锰的含量具有重要的意义。
检测方法：比色法，原子吸收法或电感耦合等离子质谱（ICP-MS）等。
1.比色法
在酸性溶液中，加热煮沸的时候，用强氧化剂将二价锰氧化成高锰酸离子，溶液就会出现紫红色。在波长为540nm的分光光度计或酶标仪上，测定吸光度值。在一定范围内，颜色的深度和锰的含量是成正比的，可以通过比色法的形式来测定和计算含量。
2.ICP-MS
通过湿法或微波处理，将土壤进样到ICP-MS，通过标准曲线，计算金属元素锰的含量。